各級菌種培育后，都要區分優劣，淘汰雜菌。
(1)母種接畢，一般3天左右，菌絲萌發，4---5天后菌絲生長旺盛，強壯，尖端稍翹，向前伸長，10天左右長滿斜面。試管背面可以看到培養基底部出現褐色分泌物。
(2)木屑、麩皮培養基菌種，接種后培養3---4天，菌種塊長出白色羽毛狀菌絲，5---7天擴展深入培養基，生長速度快，呈扇形，30-40天菌絲布滿全瓶，均勻一致，為合格菌種。
(3)若瓶壁與培養基間出現淡黑色膠質物，這是由于移接次數太多，引起的早熟現象。栽培后，耳片小，不易長大，應淘汰。
(4)如菌種中仍可見到木屑顆拉，系培養時間短，應繼續培養，如仍無變化，則可能是營養不足造成的。用稻糠代替米糠或麩皮有可能補救。
瓶底積存黃色液體，是過期的老菌種，應淘汰，不能作菌種用。
(5)菌種只在一個角落上生長，細菌和其它雜菌污染的可能性最大，由于拌料不勻而使培養料太干或太濕也是可能的原因之一。
(6)菌絲灰白色，不是潔白色，這是根霉污染，應立即滅菌或挖出深埋。
